ChatRoom-20160125

 

201601251

GOEAST 相較於其他 GO 分析網站的優點

  • GOEAST 方便操作

  • 分析的物種相當廣泛

  • 分析的來源除了能上傳基因列表(Gene List) 外,更能上傳 Microarray probe ID

  • 結果的呈現簡單易懂,以流程圖表示三大類 Biological Process、Cellular Component、Molecular Function 的上下游關係

 

在此以 Gene List 為例, 為各位介紹如何操作 GOEAST 的流程

http://omicslab.genetics.ac.cn/GOEAST/php/batch_genes.php

 

Step1: 先選擇分析物種

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Step2:選擇正確的基因格式後上傳 (在此以 Gene Symbol 為例)

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Step3: 使用預設值, 接著輸入e-mail後, 就可按下 “start analysis”

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分析完成的畫面

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Gene Ontology 分析結果

  • Overlook of Enriched GO Terms

以流程圖形表達結果, 可分別觀看 Biological Process、Cellular Component、Molecular Function 三大類的上下游關係

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( 擷取部分結果 )

Detail information

包含三大類的全部結果

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( 擷取部分結果 )

 

若是對 GOEAST 網站的分析有興趣或是對結果有疑惑,歡迎至分生所生物資訊室討論

謝謝分生所Dr.徐唯哲提供

 

 

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